Beobachte, ob es einen "erkennbaren" Grund gibt. Wenn ja, versuche Deine Position zu ändern, um ihn auszuschliessen.
Die Lotus-Position ist die Beste, doch wer sagt, das sie zwingend ist? Ich brachte mal das Beispiel eines Übenden nach einem Unfall und steifem Bein.
Sollte sich kein Grund finden lassen, lass es doch mal vom Doc abchecken. Ev. besteht eine Aderverengung, die Dich sonst nicht stört.
Ich habe ähnliche Probleme gelöst, indem ich speziellen Muskelaufbau im Rücken durchführte.
Vielleicht hilft Dir das, doch habe ich erfahren, das Beinschmerzen irgendwie "dazugehören". 
